Na zbiory sekcji germanistycznej BWN składają się książki i czasopisma (a także płyty) związane głównie z Niemcami, Holandią, Szwajcarią i Austrią. Dzięki bogatemu księgozbiorowi można poznać języki niemiecki i niderlandzki, ale też jidysz czy afrikaans. Na szczególną uwagę zasługuje komplet „Studiów Niemcoznawczych” – najstarszego czasopisma germanistycznego w Polsce.
Sekcja kontynuuje działalność Biblioteki Instytutu Germanistyki UW, która działała w latach 1960–2022. Podstawą zbiorów germanistycznych był m.in. księgozbiór Wyższej Szkoły Języków Obcych. Potem zbiory wzbogaciły się o książki, które dr Florian Witczuk przywoził z podróży po Ziemiach Zachodnich i Północnych.